Los efectos nocivos que puede causar el láser se limitan a los ojos. Las lesiones oculares que se manifiestan varían según la longitud de onda de la luz láser. Los láseres rojos e infrarrojos utilizados en fototerapia pueden causar los siguientes efectos:
Luz visible de 400 a 780 nm (el láser rojo utilizado tiene una longitud de onda aproximada de 685 nm):
La retina sufre lesiones térmicas y fotoquímicas, ya que todos los demás elementos del globo ocular son transparentes a estos haces.
Rayos infrarrojos A, de 780 a 1,400 nm (el láser infrarrojo utilizado tiene una longitud de onda aproximada de 830 nm):
Estas longitudes de onda son las más peligrosas para el ojo, ya que no percibe los haces de esta longitud pero los enfoca en la retina, donde causan quemaduras graves y daños fotoquímicos a la retina. Además, algunos de estos haces son absorbidos por la lente, lo que provoca turbidez, es decir, cataratas.
Esto significa que nunca podemos mirar directamente al rayo láser y el uso de gafas por parte del paciente, operador y asistente es indispensable.